Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms