Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP46P62068 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP46P62068 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
USP46P62068 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP46P62068 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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