Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AP3M2P53677 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms