Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP214P35658 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NUP214P35658 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms