Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RLBP1P12271 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RLBP1P12271 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms