Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGAMP11215 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms