Protein–RNA interactions for Protein: A4D263

C7orf72, Uncharacterized protein C7orf72, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf72A4D263 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C7orf72A4D263 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms