Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC12A4Q9UP95 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms