Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDH7Q9ULB5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms