Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTSFQ9UBX1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms