Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDRD1Q9BXT4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms