Protein–RNA interactions for Protein: Q96F85

CNRIP1, CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNRIP1Q96F85 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNRIP1Q96F85 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms