Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C18orf8Q96DM3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms