Protein–RNA interactions for Protein: Q96D71

REPS1, RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPS1Q96D71 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
REPS1Q96D71 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
REPS1Q96D71 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms