Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C9orf40Q8IXQ3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf40Q8IXQ3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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