Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ANKRD39Q53RE8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms