Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms