Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PCK2Q16822 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms