Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PMS2P11Q13670 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms