Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LSAMPQ13449 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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