Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CSTF3Q12996 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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