Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SCAPQ12770 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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