Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms