Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GABPB1Q06547 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABPB1Q06547 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms