Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HERVK_113P61574 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms