Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB15P59190 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms