Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GSK3BP49841 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms