Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GRIA4P48058 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GRIA4P48058 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms