Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ACADSBP45954 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ACADSBP45954 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms