Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP24386 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP24386 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHMP24386 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms