Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CD247P20963 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CD247P20963 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CD247P20963 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms