Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GJA1P17302 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA1P17302 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA1P17302 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA1P17302 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA1P17302 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GJA1P17302 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GJA1P17302 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GJA1P17302 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GJA1P17302 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms