Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
VPREB1P12018 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms