Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB3P05106 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms