Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRRTM2O43300 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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