Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NDUFS4O43181 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFS4O43181 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms