Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H3BNH8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H3BNH8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H3BNH8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms