Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARID3CA6NKF2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms