Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GOLGA6L9A6NEM1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms