Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GABARAPL3Q9BY60 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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GABARAPL3Q9BY60 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GABARAPL3Q9BY60 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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