Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RBBP8Q99708 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms