Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC45A3Q96JT2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC45A3Q96JT2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms