Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms