Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNHIT3Q15649 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNHIT3Q15649 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms