Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms