Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
APOFQ13790 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms