Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK6Q00534 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK6Q00534 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDK6Q00534 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms