Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRMP28827 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
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