Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms