Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRRT4C9JH25 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRRT4C9JH25 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms